Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms