Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc162pQ0VG85 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms