Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
TrioQ0KL02 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms