Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms