Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pate4Q09098 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms