Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cnn1Q08091 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Cnn1Q08091 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Cnn1Q08091 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Cnn1Q08091 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Cnn1Q08091 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cnn1Q08091 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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