Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gdf3Q07104 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gdf3Q07104 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gdf3Q07104 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Gdf3Q07104 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms