Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Mc1rQ01727 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms