Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sec23aQ01405 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sec23aQ01405 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sec23aQ01405 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sec23aQ01405 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sec23aQ01405 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sec23aQ01405 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Sec23aQ01405 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Sec23aQ01405 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Sec23aQ01405 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Sec23aQ01405 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Sec23aQ01405 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Sec23aQ01405 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Sec23aQ01405 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec23aQ01405 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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