Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gjb2Q00977 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms