Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rbp4Q00724 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms