Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms