Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx2P81066 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Irx2P81066 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Irx2P81066 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx2P81066 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms