Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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