Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr1bP70700 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms