Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NficP70255 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NficP70255 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NficP70255 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NficP70255 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NficP70255 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NficP70255 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NficP70255 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NficP70255 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NficP70255 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NficP70255 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NficP70255 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NficP70255 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NficP70255 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NficP70255 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NficP70255 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NficP70255 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NficP70255 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NficP70255 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NficP70255 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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NficP70255 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NficP70255 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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