Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SbdsP70122 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms