Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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