Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ppfia3P60469 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ppfia3P60469 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms