Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Irf5P56477 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Irf5P56477 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Irf5P56477 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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