Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2e3P52483 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms