Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.2 ms