Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rfx1P48377 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms