Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gli1P47806 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gli1P47806 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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