Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NodalP43021 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NodalP43021 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms