Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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