Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ThpoP40226 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ThpoP40226 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms