Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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