Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp4P35123 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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