Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cd28P31041 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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