Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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