Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms