Protein–RNA interactions for Protein: P25318

Col8a2, Collagen alpha-2(VIII) chain, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a2P25318 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Col8a2P25318 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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