Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pou3f1P21952 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms