Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fcer1aP20489 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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