Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms