Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms