Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18524 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18524 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18524 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18524 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18524 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18524 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18524 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18524 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18524 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18524 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms