Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Spi1P17433 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms