Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxa5P09021 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxa5P09021 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxa5P09021 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms