Protein–RNA interactions for Protein: P03953

Cfd, Complement factor D, mousemouse

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfdP03953 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfdP03953 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfdP03953 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfdP03953 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfdP03953 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfdP03953 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfdP03953 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfdP03953 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfdP03953 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CfdP03953 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfdP03953 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CfdP03953 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CfdP03953 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CfdP03953 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CfdP03953 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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