Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa7P02830 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms