Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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BckdkO55028 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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BckdkO55028 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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BckdkO55028 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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BckdkO55028 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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BckdkO55028 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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BckdkO55028 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BckdkO55028 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms