Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TsksO54887 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TsksO54887 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TsksO54887 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TsksO54887 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TsksO54887 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TsksO54887 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TsksO54887 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TsksO54887 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms