Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Dgcr6O35347 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Dgcr6O35347 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Dgcr6O35347 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Dgcr6O35347 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Dgcr6O35347 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Dgcr6O35347 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Dgcr6O35347 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Dgcr6O35347 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Dgcr6O35347 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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