Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
MttpO08601 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
MttpO08601 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
MttpO08601 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
MttpO08601 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
MttpO08601 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
MttpO08601 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
MttpO08601 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
MttpO08601 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
MttpO08601 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
MttpO08601 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
MttpO08601 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
MttpO08601 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
MttpO08601 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms