Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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