Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp35M0QWN7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp35M0QWN7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp35M0QWN7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp35M0QWN7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp35M0QWN7 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp35M0QWN7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp35M0QWN7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp35M0QWN7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms