Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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