Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm7847-201ENSMUST00000151645 777 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 4930512B01Rik-202ENSMUST00000188608 983 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 4933439J24Rik-201ENSMUST00000200866 853 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm8256-202ENSMUST00000227964 828 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Sh2d1a-201ENSMUST00000005839 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Pdha2-201ENSMUST00000057860 2352 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Amn1-202ENSMUST00000111535 1457 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms